De nuchtere Française Sarah voedt haar jonge dochter Stella alleen op. Ze is een toegewijd moeder en Sarah en Stella hebben een nauwe band. Sarah is ook een briljante en gedreven astronaut, die geselecteerd wordt voor een ambitieuze – door mannen gedomineerde - ruimtemissie, samen met de chauvinistische Amerikaan Mike en de vredelievende Rus Anton. Ze bereidt zichzelf en Stella voor op haar langdurige afwezigheid en fysiek in topconditie begint ze aan de zware training in Rusland. Het is het begin van een emotionele rollercoaster, waarin ze moet schipperen tussen haar persoonlijke dromen en behoeften en die van haar kind. Nu ze de aarde gaat verlaten, beseft Sarah dat ze zich er meer mee verbonden voelt dan ooit.

De Franse filmicoon Fabienne wordt door iedereen in haar omgeving op handen gedragen. Voor de uitbreng van haar memoires keert haar dochter Lumir met haar gezin vanuit New York terug naar Parijs. Het is voor Lumir geen verrassing dat alles in haar ouderlijk huis nog altijd om haar moeder draait. Vol verbazing leest ze de fantasierijke biografie van haar moeder. Fabienne heeft echter geen tijd om stil te staan bij de vragen die Lumir hier over heeft. Ze is druk bezig met de voorbereidingen van een nieuw filmproject. De reünie tussen moeder en dochter verandert in een hevige confrontatie, waarbij weggestopte trauma’s worden opgerakeld en de waarheid eindelijk boven tafel komt. 

Ema danst in het experimentele gezelschap van haar man, choreograaf Gastón (Gael Garcia Bernal). Het huwelijk van het stel wordt hevig op de proef gesteld, wanneer Ema vastberaden is hun zoon terug te krijgen nadat ze de adoptie hebben teruggedraaid. Schuld, liefde en hoop komen samen in dit visuele spektakel, dat je nog lang bijblijft. Muzikant en kunstenaar Nicolas Jaar componeerde de pompende ambient-reggaeton-soundtrack van EMA, waarmee de film een spektakel is voor oog en oor.  
 

Acteur Shia LaBeouf speelde in verschillende grote Hollywoodfilms. Zijn ster was rijzende, maar het enfant terrible LaBeouf maakte vaak ruzie, raakte verslaafd en viel al weer snel van zijn voetstuk. Hij krabbelde later weer op en wist zich opnieuw uit te vinden. En nu is daar Honey Boy. Een persoonlijk project waarvoor hij zelf het scenario, gebaseerd op zijn veelbewogen ervaringen als jonge acteur en zijn complexe relatie met zijn vader. Shia LaBeouf laat op semi-autobiografische wijze zien hoe hij als tiener beroemd werd om vervolgens als volwassene in een afkickkliniek te belanden.